Sunday, 17 January 2016

Otomatisasi Pendeteksian Sel Blast dan Sel Metafase dengan Perangkat Lunak Pengolahan Citra Sumber Terbuka

Tingkat toksisitas senyawa dapat diketahui berdasarkan nilai indeks mitosis pada sel limfosit darah tepi. Analisis indeks mitosis pada umumnya dilakukan secara manual menggunakan mikroskop cahaya pada perbesaran rendah dengan mengidentifikasi sel metaphase dan sel blast (nucleus sel interfase yang terstimulasi). Proses identifikasi sel blast dan sel metaphase dapat dilakukan secara otomatis menggunakan perangkat lunak pengolahan citra sumber terbuka yaitu ImageJ 1.4.7. program macro yang dapat mendeteksi secara otomatis blast dan sel metaphase telah dibuat untuk memudahkan analisis indeksmitosis.

Tujuan penelitian ini adalah mengetahui keakuratan program macro pada ImageJ 1.4.7 untuk mendeteksi secara otomatis sel blast dan sel metaphase. Sel darah tepi dari tiga donor berbeda dibiakkan dan dibuat preparatna, kemudian sebanak tiga puluh citra dibuat. Hasil penghitungan jumlah total sel blast dan sel metaphase secara otomatis dan manual diolah secara statistic menggunakan Uji T. Taraf nyata yang digunakan (α) adalah 0,05. Hasil penelitian menunjukan bahwa tidak terdapat perbedaan nyata anatara jumlah sel blast dan sel metaphase yang diperoleh secara otomatis dengan manual (P=0,69 dan P=0). 

Jumlah sel blast dan sel metaphase yang dihitung secara otomatis lebih rendah (underestimated) dibandingkan nilai sebenarnya. Beberapa factor yang menyebabkan hal tersebut akan dibahas secara tererinci didalam makalah. Secar keseluruhan program macro yang dibuat dapat digunakan untuk mendeteksi dan menghitung dengan jumlah oal sel blast dan sel metaphase. Meskipun hasil yang diperoleh tidak lebih baik dari hasil penghitungan secara manual. Pengembangan lebih lanju terhadap program macro atau penggunaan perangkat lunak pengolahan citra yang dikhususkan untuk bidang biologi yaitu CellProfiler 2.0 perlu dilakukan sehingga penghitungan nilai indeks mitosis dapat dilakukan secara lebih cepat dan akurat untuk mengetahui tingkat toksisitas suatu senyawa.

Link jurnal lengkap dapat didownload disini

0 komentar:

Post a Comment